Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms