Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms