Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnnm1Q0GA42 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnnm1Q0GA42 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms