Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Tgm3Q08189 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms