Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cntn3Q07409 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms