Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Siah1bQ06985 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms