Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Tac1-205ENSMUST00000185187 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm37934-201ENSMUST00000192902 402 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox12Q04890 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms