Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Scg2Q03517 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms