Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gjb5Q02739 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms