Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gjb4Q02738 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gjb4Q02738 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms