Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
VcpQ01853 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms