Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gja5Q01231 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gja5Q01231 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gja5Q01231 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja5Q01231 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja5Q01231 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gja5Q01231 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms