Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PrcdQ00LT2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms