Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Apoa1Q00623 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms