Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smarcc1P97496 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms