Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pitx2P97474 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms