Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pkp1P97350 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp1P97350 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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