Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
H3f3aP84244 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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