Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irx1P81068 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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