Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Irx3P81067 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Irx3P81067 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms