Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

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Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprvP70289 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprvP70289 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprvP70289 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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PtprvP70289 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprvP70289 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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PtprvP70289 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PtprvP70289 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms