Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chl1P70232 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms