Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Rps11P62281 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rps11P62281 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms