Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GferP56213 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GferP56213 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GferP56213 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
GferP56213 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
GferP56213 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
GferP56213 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms