Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Sh3bp1P55194 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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