Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LtbrP50284 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms