Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab11bP46638 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms