Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cdkn1bP46414 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms