Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ThpoP40226 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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