Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tjp1P39447 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms