Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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