Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Saa4P31532 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Saa4P31532 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Saa4P31532 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms