Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Hoxc11P31313 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Hoxc11P31313 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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