Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NapbP28663 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NapbP28663 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NapbP28663 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NapbP28663 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NapbP28663 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NapbP28663 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms