Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atxn10P28658 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atxn10P28658 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atxn10P28658 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Atxn10P28658 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atxn10P28658 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Atxn10P28658 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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