Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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