Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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