Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms