Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrkchP23298 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PrkchP23298 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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