Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pou3f1P21952 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms