Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PrkcaP20444 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms