Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VimP20152 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VimP20152 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VimP20152 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
VimP20152 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
VimP20152 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms