Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P20040 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P20040 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P20040 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P20040 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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P20040 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P20040 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P20040 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
P20040 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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P20040 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P20040 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
P20040 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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P20040 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
P20040 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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