Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cox4i1P19783 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms