Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NefhP19246 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NefhP19246 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NefhP19246 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NefhP19246 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms