Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnnc1P19123 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnnc1P19123 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms