Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms