Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
P10404 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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P10404 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
P10404 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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