Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Hoxd3P09027 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxd3P09027 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms