Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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